導演:AIC
主演:未知
20世紀末,一種被稱為“B細胞”的物質被發現存在于生物體內,這種物質會直接侵入生物的DNA內部,使其產生異變。科學家們對這種奇妙的物質產生了極大的興趣,為此進行了多次動物實驗,并秘密地準備將B細胞用在人體上。高中生海堂佑司在不知不覺中成為了犧牲品,也因B細胞的活性化而被診為不治之癥,進入了精心安排下的冷凍睡眠。在這段時間內,由于動物體內的B細胞無法通過冷凍來抑制,使其發生了突變增殖引發了物種變化,兔子和小狗成為了巨大的蟲狀怪物 BLUE。它們在很短的時間內交配繁殖,并將人類當作了自己的食物。整個世界很快就被數量龐大的BLUE所占據,只有1千萬左右被選出的人逃到了太空殖民地“第二地球”里,而剩下的人類卻只能留在地面上被BLUE所蹂躪…似乎人類還沒有完全絕望,太空站上的科學家通過一份過去的研究報告得知,身體里繁衍著B細胞的人類將能有效地打擊BLUE,這些珍貴的生物兵器被稱為“SLEEPER”,而回收他們就成了第二地球軍隊的頭號任務。瑪琳·安吉拉所在的機甲戰士小隊奉命回收日本地區的SLEEPER,但在冷凍庫受到了BLUE的伏擊,損失慘重,唯一安全回收的只有佑司。回到太空站的旅途一樣艱辛,本不會游泳的BLUE 通過海底管道突襲了人類的海上基地,混戰中回收小隊的成員死傷殆盡,只有瑪琳、佑司、喬伊及重傷的隊長羅伯特逃出生天。他們之后幾乎每到一處都遭到了 BLUE的襲擊,在韓國,羅伯特和喬伊相繼死在BLUE爪下,剩下瑪琳和佑司兩人結伴前往拜科努爾宇宙基地。在旅途中生死相交的兩人慢慢產生了感情,在戰場上約好不論經歷多少苦難,都一定要在宇宙再見……告別血戰之后的拜科努爾,兩人好不容易來到第二地球,卻發現高層評議會正在進行著秘密的計劃。佑司被配給了新型的機動戰士,但他在之后的戰斗中卻變得異常冷酷,和以前判若兩人。通過反抗組織領袖的述說,瑪琳得知SLEEPER能對抗BLUE的原因,是因為其體內的B細胞在新型的機動戰士催化下急速活性化,從而能預測BLUE的行動。也就是說,隨著佑司他們駕駛新型機動戰士的時間增長,SLEEPER本身正因為B細胞的增殖而使他們正慢慢變成BLUE!知道真相的瑪琳加入了反抗組織,決心拯救她一直深愛著的佑司,當他們與評議會的軍隊交火時,另一名SLEEPER東尼突然帶著一大群BLUE自地球戰場闖入…